O time do Morumbi conquistou sua primeira Copa Libertadores da América em 1992, ao vencer o Newell’s Old Boys, da Argentina. No jogo de ida, a Argentina venceu por 1 a 0, e no jogo em casa, o São Paulo também venceu pelo mesmo placar. A equipe orientada pelo experiente Telê Santana teve que recorrer aos pênaltis, que acabou vencendo por 3 a 2.
O time paulista tinha um elenco fantástico, com jogadores como Zetti, Pintado, Cafu, Raí, Muller, Antônio Carlos e outras estrelas. Mais de 105 mil torcedores são-paulinos estiveram no Morumbi para comemorar sua primeira Copa Libertadores.
A alegria da torcida são-paulina não acabou com esse sucesso de 92: no ano seguinte, em 1993, na 34ª edição da Copa Libertadores da América, as três cores mais uma vez trouxeram muita alegria aos seus torcedores.
O clube do Morumbi conquistou o segundo troféu consecutivo ao derrotar os chilenos da Universiti Católica na final por 5 a 1. Com quase 100 mil torcedores, o estádio do Morumbi entrou em erupção para a segunda disputa. Esta foi de longe a maior derrota alguma vez registada num jogo de qualificação para a final do torneio.
Apesar de perder por 2 a 0 para o Chile, o São Paulo, com grande vantagem na segunda rodada, ergueu o troféu e sagrou-se bicampeão da Copa Libertadores da América.
O time de Telê Santana manteve boa parte do elenco em relação ao ano passado, e contou com craques como Zetti, Cafu, Raí, Pintado, Muller e Toninho Cerezo, além de outros jogadores importantes e completos, mesmo e depois de vencer O time dos sonhos do Barcelona na Copa Interclubes do Japão.
Em 1994, o tricolor do Morumbi estava prestes a realizar o sonho de três campeonatos consecutivos, mas os argentinos do Vélez Sarsfield negaram.
Os irmãos venceram o jogo de ida, no Estádio José Amalfitani, em Buenos Aires, e acabaram perdendo por 1 a 0 no Morumbi.
O torneio foi decidido nos pênaltis, e o time de Buenos Aires acabou vencendo por 5–3 e sagrando-se campeão do torneio.
O São Paulo voltou forte em mais uma final da Libertadores em Foi a 46ª edição da competição, e a rivalidade acabou colocando duas equipes brasileiras entre si, São Paulo e Atlético Paranaense.
O primeiro encontro aconteceu no estádio Beira Rio, em Porto Alegre, e terminou empatado em 1 a 1, mas no segundo as três cores se intensificaram e acabaram quebrando a tempestade treinada por Antônio Lopes, resultando na derrota por 4 a 0 e , desta forma, tornando-se tricampeão da Copa Libertadores da América.
Na época, o técnico do São Paulo era Paulo Autuori e contava com um elenco de primeira linha, incluindo Rogério Ceni, Cicinho, Lugano, Amoroso, Josué, Danilo e outros jogadores de destaque.
Porém, no ano seguinte, 2006, ainda impulsionado pelo terceiro lugar na Libertadores e pela vitória na Copa do Mundo contra o Liverpool, o tricolor do Morumbi não conseguiu enfrentar o Internacional de Porto Alegre, então treinado por Abel Braga. O Colorado conquistou recentemente o troféu do campeão mundial São Paulo.
O time de Abel venceu por 2 a 1 no Morumbi e empatou em 2 a 2 em Porto Alegre. Após 97 anos de espera, o Internacional de Porto Alegre conquistou a primeira Copa Libertadores da América. Mesmo Muricy Ramalho, no comando de um time de estrelas, como Rogério Ceni, Lugano, Ricardo Oliveira (que não conseguiu disputar a final), entre outros, não conseguiu impedir o Internacional de realizar seu sonho.
As três cores do Morumbi detêm um recorde na Libertadores que até agora não foi superado. É a única seleção brasileira a ter disputado três finais consecutivas do torneio, em 1992, 1993 e 1994. Apesar dos anos ruins, nenhuma seleção brasileira conseguiu ultrapassar a marca dos três títulos. E antes que Flamengo e Palmeiras deixem de ser bi com sucesso recente, quem sabe, quem sabe, talvez o São Paulo consiga alcançar o tetra inédito?